Assim como não pode faltar a aplicação móvel do Facebook num smartphone, também não pode faltar o Messenger, a ferramenta de mensagens instantâneas para os membros desta rede social. Messenger, também chamado de Facebook Messenger, facilita a troca de mensagens de texto, mensagens de voz, fotos e vídeos entre contatos do Facebook. Também permite chamadas gratuitas de voz e vídeo, tanto de pessoa a pessoa quanto em grupos de até 50 pessoas. Suas salas de reuniões virtuais permitem, entre outras coisas, que os participantes assistam ao mesmo vídeo juntos e compartilhem suas diferentes reações ao conteúdo veiculado.
Suas principais características incluem a função de compartilhamento de localização, a capacidade de usar filtros e efeitos durante as videochamadas, um modo escuro e o novo modo efêmero, que destrói as mensagens após o término da conversa. O Messenger também é a ferramenta de comunicação entre compradores e vendedores no Facebook Marketplace e com os serviços de atendimento ao cliente de muitas empresas que possuem contas no Facebook. Atualmente, o Facebook Messenger não se limita apenas a conectar usuários do Facebook, mas também ampliou seu escopo para o Instagram, outra rede social gerenciada pelo Facebook.